El Complejo Educativo depende orgánicamente de la Conselleria de Educación, Investigación, Cultura y Deporte, a través de la Dirección Territorial de Valencia de dicha Conselleria.
El Decreto 54/1988, de 25 de abril, del Consell de la Generalitat Valenciana, por el que se reestructura y regula el Complejo Educativo de Cheste, establece los principales órganos de gobierno unipersonales de los que dispone el Complejo, así como las funciones de cada uno:
– Gerente del Complejo: ostenta la dirección en la organización general del Complejo, y la representación oficial del mismo, dirige y coordina los servicios, instalaciones y uso de los espacios, edificios y construcciones de uso común, dirige y coordina las actividades generales del Complejo y las comunes a los diferentes centros docentes, coordina también la actividad económica y administrativa de los servicios y recursos comunes, así como la adecuada gestión y racionalización del presupuesto de gastos generales y aquellas otras funciones y responsabilidades atribuidas reglamentariamente por la Conselleria de Educación, Investigación, Cultura y Deporte.
– Director del Centro de Residencias: ostenta oficialmente la representación de dicho centro, dirige y coordina todas las actividades del centro en colaboración con la Gerencia, ejerce la jefatura de todo el personal que tenga adscrito, confecciona horarios de funcionamiento residencial y cualquier otra que se le asigne reglamentariamente.
– Directores de los centros educativos: representan oficialmente a sus respectivos centros, cumplen y hacen cumplir con la normativa vigente, velan por la adecuada gestión presupuestaria, gestionan ante servicios competentes la dotación de materiales y personal del centro, visan las certificaciones y los documentos oficiales del centro y cualquier otra que se le asigne de acuerdo a la normativa vigente.